遊雅堂 特典コードの機能を理解するための細菌の研究

ヨーテボリ大学のBjörnBurmann博士は、バクテリアに関する彼のチームの研究が遊雅堂 特典コード理タンパク質の機能に関する新しい洞察をどのように提供しているかを説明しています。

単純な細菌から植物や哺乳類まで、すべての生物の生物が保証される基本的な細胞プロセスの1つは、私たちの遺伝物質である遊雅堂 特典コードの複製です。生物の遊雅堂 特典コードでは、すべての情報が本質的に「ハードコード」されているため、すべての複製されたコピーが元のコピーと同じであることを保証します。

ヌクレオチド切除修復

進化は、エラーのために遊雅堂 特典コードをスクリーニングするさまざまなソリューションを思いついたが、私のチームにとっては、異なる細胞機械間の結合が長年にわたる関心を持っている(Burmann etal。2010)。また、細胞はRNAポリメラーゼを使用して転写プロセスを駆動します。転写プロセスは、ゲノム遊雅堂 特典コードをRNAに転写し、遊雅堂 特典コードの壊れたセンサー、またはによって作成された付加物として、タンパク質に変換できるRNAに転写します。UV-lightおよび代謝剤(Truglio etal。2006)。その後、RNA-ポリメラーゼは、DNA損傷の周りに短いストレッチを切り取り、それを置き換えるさまざまな遊雅堂 特典コードを補充します。

遊雅堂 特典コード
図Uvrd-helicaseの1構造。

MFD

RNA-ポリメラーゼを損傷センサーとして使用することにより、転写と遊雅堂 特典コードが直接結合されるため、プロセス全体が一般に「転写結合修復」(TCR)と呼ばれます。 DNA損傷部位に近づくと、これらの部位で、いわゆる「失速した転写複合体」であるRNAPが停止します。

次に、MFDは遊雅堂 特典コード機械をDNA病気に補充して修復を開始することができます。それにもかかわらず、MFDを欠く細菌に対するUV放射とDNA損傷剤に対する軽度の感受性は、この経路が唯一の責任のある細胞プロセスであるかどうかについて早期に疑問を投げかけました。

遊雅堂 特典コード
図2 UVRD-CTDの機械的役割の提案。

MFDを超えて

最新の研究では、転写と遊雅堂 特典コードを調節する他の2つの重要なタンパク質であるNUSAとUVRDが、MFDに依存しない経路を介してTCRに大きく貢献するため、代替募集因子であることが示されています(Belogurov and Artsimovitch、2015)。これらの新たに発見された経路の重要性は、ヌサとUVRD変異体がUV誘発DNA損傷に対する高感度を示しているため、遺伝的レベルで証明されています。

in私たちの研究現在、3つのタンパク質(MFD、UVRD、およびNUSA)の詳細な役割を解明することを目的として、これらの修復経路におけるUVRDおよびNUSAの関与の構造的および機能的な詳細に焦点を当てています。重複する機能の。

最近、Uvrd-helicaseの構造と機能の関係に関する研究は、重要な新しい洞察を提供しました。 UVRDの結晶構造はすでに知られていますが、顕著な質問がありました。タンパク質の最後の90残基は何らかの形で構成されていますか?

遊雅堂 特典コード-Repairタンパク質
BjörnBurmann博士、Burmann Group准教授

チューダードメイン

結晶学的研究は、これらの残基が大部分が構造化されていないことを示したため、以前は構造調査から省略されていました。ソリューションNMR-spectospocyを使用することにより、私のチームは、この領域が非構造化されていないことを示すことができましたが、チューダードメインと呼ばれる小さないわゆる「βバレル」構造に折りたたまれます(Kawale and Burmann、2020

驚くべきことに、私たちの研究は、このドメインがその特性に高い可塑性を示して、RNAポリメラーゼや遊雅堂 特典コードなどの非常に異なる結合パートナーに結合し、洗練された構造変調によって達成することを明らかにしました。私たちの仕事は、相互作用パートナーの曖昧さが、バインディングハブとしてのこのドメインの役割の鍵である可能性があることを示しています。

参照

Burmann、B。M。et al。 「nuse:nusg complexは転写と翻訳をリンクします」。

Truglio、J。J.、Croteau、D。L.、Van Houten、B。およびKisker、C。化学。

Sancar、A。and Rupp、W。D. Cell 33、249–260(1983)

Selby、C。P.およびSancar、A。「転写修復カップリングの分子メカニズム」。 Science 260、53–58(1993)

Belogurov、G。A.およびArtsimovitch、I。「転写伸びの規制」。アン。

Kawale、A。A.およびBurmann、B。M. Commun Biol 3、607(2020)

謝辞

スウェーデンの研究評議会(Vetenskapsrådet)とKnut Och Och Alice Wallenberg Foundationからの継続的な資金、Wallenberg Academy Fellowship、およびWallenberg Center for Molecular and Translational Medicine、Gothenburgの大学を通じて、スウォーデンに感謝しています。ヨーテボリ大学のスウェーデンNMRセンターは、分光計の時間を認められています。

遊雅堂 特典コード

注意してください、この記事は私たちの第5版にも掲載されます四半期公開.

貢献者の詳細

Björn氏
Burmann
化学および分子生物学科、ヨーテルブルクのワレンバーグ翻訳医学部
准教授、バーマングループ
電話:+46 31 786 3937

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