EMBLの欧州バイオインフォマティクス研究所のポスドク研究員であるサラキルコインは、ゲノムシーケンスを使用してバレットの食道産の患者のリスクを正確に予測する新たに発達した統計モデルについて議論します。
食道癌は、世界で8番目に一般的な癌です。英国、ヨーロッパ、および米国（食道腺癌）で最も一般的なサブタイプは、バレット食道と呼ばれる状態から発達します。
現在、ケンブリッジ大学（英国）の研究者、欧州分子生物学研究所の欧州バイオインフォマティクス研究所（EMBL-EBI）の研究者、および協力者は、ゲノムデータを使用してバレットの患者がバレットの患者を持っているかどうかを正確に予測する統計モデルを開発しました。癌を発症するリスクが高いまたは低い。
サラ・キルコイン、訪問後のフェローでembl-ebiおよびNatureで発表された新しい研究の共著者イノベーション ダファベット 入金不要 新しい方法が、食道癌を発症するリスクが高いバレットの患者やリスクの低い患者を以前に特定するのに役立つ方法について、侵入監視手順の必要性を減らすことができます。
おそらく、食道癌が通常どのように診断されるか、および患者が通常受けなければならない監視手順を説明することから始めることができますか？
新しく出版された論文の研究は、食道腺癌の癌前の状態であるバレットの食道に焦点を当てています。バレットの食道はそれ自体が危険ではありませんが、入金 不要 オンライン カジノことを意味します。
バレットは、内視鏡検査を投与し、食道生検を服用することにより診断されます。通常、持続性胃食道逆流症（GERD）の症状を呈した患者に診断されます。バレットが確認された場合、患者は通常2〜3年ごとに繰り返し内視鏡検査で監視を受ける必要があります。
内視鏡は、端にカメラを備えた照らされたチューブで、口から胃まで食道を通過します。これは最小限の侵襲的処置と見なされますが、一部の患者はそれをあまりよく許容していないため、非常に不快になる可能性があります。
内視鏡検査中に、専門家の胃腸の医師がカメラが見ているものを評価します。具体的には、彼らはそれが癌に向かって進行していることを示唆するかもしれないバレットの変化を探しています。
患者が高悪性度異形成、または初期がんと診断される場合、内視鏡（粘膜切除または無線振動として知られる内視鏡を介して行うことができる治療が推奨されます。これらの技術には、内視鏡を介して微小な手術を行うか、無線周波数入金 不要 オンライン カジノを使用して組織の最初の層を燃やし、それにより癌性になりつつある細胞を除去することが含まれます。
現在、バレットの患者が癌を発症するリスクがあるかどうかを特定する唯一の実際の方法は、病理学者によって提供される生検の格付けによるものです。高品質の異形成は、患者が食道腺癌を発症する患者の非常に高いリスクがあることを意味しますが、それを特定して除去するのは簡単ですが、それ以下のグレード以下のグレードがあります。
ゲノムデータを使用して、バレットの食道入金 不要 オンライン カジノか低いかを正確に予測する統計モデルを開発しました。これはどのように達成されましたか？
私たちのモデルは、かなり新しいゲノミクス技術を利用しています。私たちは、発生している突然変異をよりよく理解しようとするために、腫瘍の高さ全体の全ゲノムシーケンスをしばらく使用しています。
新しい研究のために、「低解像度または「浅いシーケンス」として知られているものを採用しました。ただし、浅いシーケンスは、データ自体の解像度も大幅に少なくなります。
患者コホートの開発も課題でした。バレットの患者のほとんどは、癌を発症することはありませんが、何年も監視を受けます。
それを超えて、新しいデータの理解と解釈に関しては常に課題があります。
研究からの最も重要な調査結果は何でしたか？患者にとって最大の利点は何ですか？
最も重要な発見は、臨床診断の数年前に患者を繊細に特定できたことです。データセットには、15年間監視されていた患者がいました。診断されるまでに8年以上のデータを持っていた患者のうち、癌を発症するリスクが高い。
ほとんどの場合、これらのリスクが時間の経過とともにかなり安定していたことです。つまり、リスクのレベルが一貫していたため、リスクの高いまたは低リスクのいずれかの患者の非常に早い段階で特定できます。
この研究には、計算生物学者と臨床医科学者との協力が含まれていました。ここに課題はありましたか？
私は計算生物学者ですが、グレッグソンは実験的な生物学者であり、プロジェクトを開始しました。したがって、彼女は臨床医とのインターフェースの多くをしましたが、私は彼らと一緒に病気の病因を理解しようとするために彼らと仕事をしました。
もちろん、常に学習曲線があります。確かに、私の側から、たとえば、特定の用語の臨床的意味が何であるか、特定の発見が実際に臨床的に意味があるかどうかを理解することで。
次のステップでは、臨床試験に進む前に方法を改良することが含まれます。ここでどのような進歩がありますか？
その意味での時間枠について話すのはおそらく時期尚早です。私たちの次のステップの1つは、より多くの患者を遡及的および前向きに登録し、開発および採用している新しいモデルとアルゴリズムの精度が患者の安全性を損なわないことを保証することです。
さらに多くのデータ型を持ち込みたいと考えています。病理学者がすでに使用していた臨床情報と、病理自体に関する情報を持ち込みたいと考えています。
最後に、モデルが将来他のがんの種類に拡張される可能性があることを期待しています。これが起こることをどのように考えていますか？
いいえ、バレットの食道患者の臨床試験が完了するまで待つ必要があるとは思わない。メソッドとアルゴリズムは確かに拡張され始めることができます。
ただし、問題は、癌前の組織のアクセシビリティと可用性に関するものです。食道組織を扱うことの利点の1つは、患者にとっては不快ですが、食道は非常にアクセスしやすい臓器であることです。
サラキルコイン
ポストドクタルフェロー
欧州バイオインフォマティクス研究所（EMBL-EBI）
SK875@mrc-cu.cam.ac.uk
ツイート@emblebi
www.ebi.ac.uk/
注意してください、この記事は私たちの第4版にも掲載されます新しい四半期出版.
